ssr_primer
Primer Details for TRINITY_DN81296_c0_g1_i2 |
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| (A)16(ACAAACAAACAAACAAACAAACAAACTCACAGTTCTTGATACATCGCTAAGATCCAGATTATCAATAAATTGTATTTTTTATGTGATATACTTTCGCTTATACTTAGATCCTTTGAGGTTCTCATTAAAAAATAAAAAATCTTACTAATAGAAGGGATAACAGGGAAATATTTAGTGCGATTATCAGAATCCATGAATTCAAATAAAAATTCGATTATTCGGGGCTTTGGCCTTATTGCGTTTCGCTTCTTTATTTTACGTGGCAGAAAAAACACCGTTTAATGATGAGTGGTGTTTTATAATGTACGAAGAAACAGAACCAAGACAACGGTATTCAAACTCACGTCTAGGCAGAATAATTACATTTCAATAATTTCCTGTTTAATTTCAAGTTCTCTAAGATGATGGTTATGCTTAGTTGAGGATTTTTAATTGATCATTATCAGGTCCTCTAAAAGTAAATTTAATAAAATATACAATACTGAAAACTTACGTGCACGCTTACTGATTGGATGGGCTTGAAATTTTGGATTTCTCCCCCTTGGCAAGCAATCATGTTTCTGGAATCGTGCGATGAGCGTAAGGTATCCCAATATTGTGTGTGCACGAAGGCTCTAACAGATAGTAAGCCGAAATAATCATCAACATATTATTTGTGTTCATAATTATTCGCTTAGCTGAGAGTGCTAGTGAAAGGGCGTGACGTAAATTAATTGATTGACGAATGCCAATTTCAGTCACAGTGTCAATGATTTAAAATTTGAAATTGTCTAATCTAGTTGACTCATATTTTATTTTGGCTTTTGCGTGAAGATGATTAGTGATTATTATTGGTCATTTGGATTGTGATCAATTAACTAATATGCAGAGTACACGGTAAAAAAATAGCTCATGAGGCTTTACTACATACGGTCTGTATTGATAGGTAGAGGCTAAATAATGTGGCATGATTTTATAGAGGTTAAACTCATATTTCACTGCTTATTATTACACTTGACATTTAATACACAGGCAATAAAAAACCCTCGGTTTTCGTTCTTCTGCAGGTGTTTCAATAATGTGATTATTTTAATGTTATATAGTCATTCAGAATGATGATAGTATGATTATAAAACGATTACAGACAATCCTATAATTTTCGCAGTAATTTAGGTGATTCATTTTAATCATTCAGTGAGATATTATGGCCTCTATTGTCCAGGCATGCATTTTGACTTTGGTAATAGCATATGCATGTGCATTTAAAAATAAGTCTTAACGCATTGATATGCATTTCCTTTGATAAAATTTTCCATCAAAGGTTTTATTCGCGATTGGAAGTAATAAAACTGAAGATTCATCTCGTATACAGGGAAATTACATAATCTCATCAATTACACGTGCTTTTAAACCAATGTGATAAAATTACCAGCAATATTCCGATTTTCCCATACTTTAGACCCATCACACACATATTGAAGAGCAAAAGTTGACTGGTCGGAGCATCATTGTGCTAAATCGGTGAATTCTTTCTCTTAAAGTGAACAACGAGAAAGAAATTAATTATGTTGATTACAAAGCACGCCCCTTTTTAACACTGGTTGATAACTTTTCATTTTGATGACTTCTAATGTCAATTAATTGAGGTCAAAGATGATAATGTGTTAAAGAAAGCCTCAGCGCCTACGAGTTTACAATACAACCATATCTCATTTTATGACGTTTAGAAGCAGTTCCATATTATGTTCCCTTATGCATATGAAACGTGTATCAGTGTTATGAAGACGAATAATTTGTCCGACCAACTGCAATCAGCCTTTTTTATAAATTCACCATAAATAATCGATTTTTCGTAATACAGCCAGCCGTGATAGATTTCGATTGTCTTATACGCATAAATTAAATAGAACCCAATGTTACGAACATGCGGAAAGTGCAATGGTGTTCGACATATTTATCTCAGGTTTTTACTTTTCCTTTTGGCCTCTCTAAAGCTGTATTTATCACCAATGCCCCTGCTGCGTGCAAGAGACGCAGCAAAGAGAACAGATTTCTCATCAGTAAAATTGCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACACGCTGGGCACATAAAGAAAGTCTGAAATTCATTCGTTTTC)(AAAC)6: Primer 1 details |
|---|
| Primer Characteristics | Forward Primer | Reverse Primer | Product Details |
| Sequence | GCGGAAAGTGCAATGGTGTT | TCTTTATGTGCCCAGCGTGT | Start: 2925 |
| Tm | 59.968 | 59.964 | End: 3150 |
| Size | 20 | 20 | 226 |
| Primer 2 details |
|---|
| Sequence | CCCTTTTGGCGTATCCTGGT | GAAACCGGAGAGGCCATTGA | Start: 76 |
| Tm | 60.034 | 60.035 | End: 304 |
| Size | 20 | 20 | 229 |
| Primer 3 details |
|---|
| Sequence | GTTGACTGGTCGGAGCATCA | AGGGGCGTGCTTTGTAATCA | Start: 2487 |
| Tm | 60.037 | 59.962 | End: 2587 |
| Size | 20 | 20 | 101 |
| Primer 4 details |
|---|
| Sequence | CGAACATGCGGAAAGTGCAA | TCTTTATGTGCCCAGCGTGT | Start: 2918 |
| Tm | 60.041 | 59.964 | End: 3150 |
| Size | 20 | 20 | 233 |
| Primer 5 details |
|---|
| Sequence | GGATTTCTCCCCCTTGGCAA | ACGCCCTTTCACTAGCACTC | Start: 1548 |
| Tm | 59.959 | 60.037 | End: 1720 |
| Size | 20 | 20 | 173 |
(A)60: Primer 1 details | | Primer Characteristics | Forward Primer | Reverse Primer | Product Details |
| Sequence | GCGGAAAGTGCAATGGTGTT | TCTTTATGTGCCCAGCGTGT | Start: 2925 |
| Tm | 59.968 | 59.964 | End: 3150 |
| Size | 20 | 20 | 226 |
| Primer 2 details |
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| Sequence | CCCTTTTGGCGTATCCTGGT | GAAACCGGAGAGGCCATTGA | Start: 76 |
| Tm | 60.034 | 60.035 | End: 304 |
| Size | 20 | 20 | 229 |
| Primer 3 details |
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| Sequence | GTTGACTGGTCGGAGCATCA | AGGGGCGTGCTTTGTAATCA | Start: 2487 |
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| Size | 20 | 20 | 101 |
| Primer 4 details |
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| Sequence | CGAACATGCGGAAAGTGCAA | TCTTTATGTGCCCAGCGTGT | Start: 2918 |
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| Size | 20 | 20 | 233 |
| Primer 5 details |
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| Sequence | GGATTTCTCCCCCTTGGCAA | ACGCCCTTTCACTAGCACTC | Start: 1548 |
| Tm | 59.959 | 60.037 | End: 1720 |
| Size | 20 | 20 | 173 |
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